Perbukitan indah di Pulau Koumi adalah salah satu dari banyak alasan wisatawan mengunjungi pantainya—alasan yang menempati urutan kedua setelah terumbu karangnya yang indah dan legenda Anne Bonnie dan Mary Read. Museum yang menyimpan pedang pendek dan pistol dari duo bajak laut pemberani ini memberikan keajaiban bagi pariwisata pulau kecil ini.
Dalam perjalanan ke pulau itu, Kogorou Mouri yang terkenal ditemani oleh putrinya Ran, sahabatnya Sonoko Suzuki, Detective Boys, dan Conan Edogawa. Setelah terjadi perselisihan di hotel mengenai kamar mereka, kelompok tersebut bertemu dengan pemburu harta karun dan mengenal demam harta karun di pulau itu. Dikirim untuk berburu sendiri, Detective Boys menjelajahi pulau; sementara di perairan yang jauh lebih keras, Conan menemukan pembunuhan. Polisi, mengikuti petunjuk dari perampokan baru-baru ini, segera tiba setelahnya, dan Koumi terjerumus ke dalam kekacauan.
Yang terjadi selanjutnya adalah tindakan gila-gilaan yang tidak hanya dilakukan oleh para pemburu harta karun tetapi juga penduduk Koumi untuk mengamankan barang rampasan Anne dan Mary yang telah lama hilang. Namun, sementara itu, Conan, Kogorou, dan polisi mencari satu hal yang jauh lebih besar daripada kekayaan—keadilan.