Di Stadion Touto, pertandingan sepak bola J. League sedang berlangsung. Selama ini, Detektif Kogorou Mouri menerima ancaman bom dari penelepon tak dikenal dan teka-teki misterius yang menunjukkan lokasinya. Conan Edogawa kini harus menyelamatkan para penggemar game tersebut sebelum waktu habis.
Untungnya, dengan tindakan cepat dan pemikiran cerdas Conan, bom tersebut ditemukan dan ledakan dapat dihindari. Pelakunya tidak berhenti di situ; Detektif Kogorou diberitahu tentang bom tersembunyi lainnya yang akan meledak di sebuah acara besar di kota. Dipaksa berpacu dengan waktu, dengan ribuan nyawa dipertaruhkan, Conan harus memecahkan teka-teki lain, menemukan lokasi bom, dan menangkap pelakunya untuk menghindari tragedi mengerikan.